Der Gemeinderat ist das oberste Verwaltungsorgan der Politischen Gemeinde Münsterlingen. Er besteht aus dem Gemeindeammann als Vorsitzenden und sechs weiteren Mitgliedern.

Der Vollzug der einzelnen Aufgaben stellt der Gemeinderat in folgenden Ressorts sicher:

Allgemeine Verwaltung und Finanzen, Werke	René Walther
Umwelt und Entsorgung	Theres Bruun
Hochbau	Yvonne de Montmollin
Öffentliche Sicherheit, Gemeindeunterhaltsdienst	Jürgen Häberli
Kultur und Freizeit	Stefan Egger
Alter und Mobilität	Michael Urech
Soziales und Gesundheit	Anita Müller